Начиная с М18 проект Mozilla разветвился. Дело в том, что браузер Mozilla, включая механизм рендеринга Gecko, был положен в основу разработки шестой версии Netscape (права на который перешли к компании AOL Time Warner), и, в то же время продолжалась разработка самостоятельного браузера Mozila 1.0. Версия 6.0 браузера Netscape-6 на основе Mozilla, которая появилась в октябре 2000 года, подверглась резкой критике, но более поздняя версия 6.1 получила положительные отклики.
В ноябре 2001 года на сайте Mozilla.org появилась бета-версия браузера Mozilla с номером 0.9.6. В Mozilla 0.9.6 исправлено несколько ошибок и добавлены новые функции, такие как отображение значков страниц в поле адреса и поддержка форматов изображений.bmp и.ico на разных платформах. В числе других